En tant que pays ACP (Afrique, Caraïbes et Pacifique), le Burundi entretient des relations avec l'UE qui sont régies par l'accord de Cotonou, signé le 23 juin 2000; cet accord vise à bâtir un partenariat global reposant sur trois piliers complémentaires : la coopération au développement, la coopération économique et commerciale et la dimension politique.

La Délégation de l'Union européenne (DUE) au Burundi est l'interface entre les institutions européennes, les institutions burundaises et la population du Burundi. Ceci implique des actions de représentation, de communication, de promotion et de suivi des politiques de l'UE auprès des autorités nationales burundaises, des organisations non gouvernementales, de la société civile, du commerce et de l’industrie.

Depuis l'entrée en vigueur du Traité de Lisbonne, la DUE exerce la présidence locale de l'UE de manière permanente et coordonne les positions politiques de l'UE dans son ensemble dans tous les domaines de sa compétence, sans se substituer aux Etats membres de l'UE.

Une partie essentielle de son travail est consacrée à la gestion de projets.